Согласно ст. 357 НК РФ плательщиками транспортного налога признаются лица, на которых в соответствии с законодательством РФ зарегистрированы транспортные средства, признаваемые объектом налогообложения.

Объектом налогообложения признаются, в частности, автомобили, зарегистрированные в установленном порядке в соответствии с законодательством РФ (п. 1 ст. 358 НК РФ). Транспортные средства, не признаваемые объектом налогообложения транспортным налогом, перечислены в п. 2 ст. 358 НК РФ.

Обратите внимание, что если иное не предусмотрено законодательством (федеральным, региональным), исключением из приведенного выше правила не являются даже транспортные средства, учитываемые в составе имущества казны. Транспортный налог по таким объектам должен уплачиваться органами, осуществляющими от имени публично-правового образования права собственника в отношении зарегистрированных за ними транспортных средств, составляющих имущество казны (см. также письма Минфина России от 23.07.2010 № 03-05-05-04/16, от 09.04.2010 № 03-05-04-04/08, от 23.09.2009 № 03-05-05-04/12, постановление Пятого арбитражного апелляционного суда от 03.11.2009 № 05АП-5165/2009).

Таким образом, главным критерием для определения обязанности налогоплательщика по уплате транспортного налога является регистрация на него транспортного средства (см. также письмо Минфина России от 25.10.2011 № 03-05-05-04/24).

Признание физических и юридических лиц плательщиками транспортного налога производится на основании сведений о транспортных средствах и лицах, на которых они зарегистрированы. Эти сведения поступают в налоговые органы в порядке, предусмотренном ст. 362 НК РФ, от органов, осуществляющих государственную регистрацию транспортных средств.

Таким образом, учреждение, получившие автомобиль в оперативное управление, будет являться плательщиком транспортного налога с момента регистрации на него автомобиля.

Следовательно, если после передачи администрацией автотранспорта в оперативное управление своему подведомственному учреждению эти транспортные средства не были сняты с учета в уполномоченных органах и не были зарегистрированы за новым балансодержателем в установленном порядке, исходя из норм действующего налогового законодательства администрация поселения по-прежнему должна уплачивать транспортный налог по указанным транспортным средствам.

Более того, поскольку обязанность по уплате налога или сбора возникает, изменяется и прекращается при наличии оснований, установленных НК РФ или иным актом законодательства о налогах и сборах (ст. 44 НК РФ), то лицо, на которое зарегистрировано транспортное средство, является плательщиком транспортного налога независимо от фактического владения данным транспортным средством (см. постановление АС Западно-Сибирского округа от 26.09.2014 № А03-19782/2013).