Пока земельные доли не находятся в муниципальной собственности, никакие меры администрация поселения принять не может, так как речь идет не о муниципальной земле.

Согласно п. 8 ст. 12.1 Федерального закона от 24 июля 2002 г. № 101-ФЗ «Об обороте земель сельскохозяйственного назначения» орган местного самоуправления поселения или городского округа по месту расположения земельного участка, находящегося в долевой собственности, вправе обратиться в суд с требованием о признании права муниципальной собственности на земельные доли, признанные в установленном настоящей статьей порядке невостребованными.

В соответствии со ст. 304 ГК РФ собственник может требовать устранения всяких нарушений его права, хотя бы эти нарушения и не были соединены с лишением владения.

После признания права муниципальной собственности на земельные доли администрация поселения будет вправе потребовать от организации освободить земельный участок.