Если основанием для увольнения работника послужило судебное решение, то его отмена является основанием для восстановления на работе.
Нужно иметь в виду, что у работодателя отсутствует право самостоятельно принять решение о восстановлении сотрудника на работе. Согласно ч. 1 ст. 394 ТК РФ работник восстанавливается на прежней работе органом, рассматривающим индивидуальный трудовой спор. Индивидуальные трудовые споры рассматриваются комиссиями по трудовым спорам и судами, если иное не установлено ТК РФ (ст.ст. 382, 348.13 ТК РФ). Однако споры по заявлениям работника о восстановлении на работе рассматриваются только в судах (ст. 391 ТК РФ).
Следовательно, либо на восстановление работника должно быть указано в резолютивной части решения суда вышестоящей инстанции, о котором Вы пишете, либо должно быть отдельное судебное решение о восстановлении на работе.
При восстановлении на работе работнику оплачивается время вынужденного прогула (ч. 2 ст. 394 ТК РФ). Размер оплаты и период, за который выплачивается сумма, должны быть указаны в решении суда и исполнительном листе. Данную сумму можно уменьшить на величину выходного пособия, выплаченного работнику при увольнении (ч. 4 п. 62 постановления Пленума ВС РФ от 17.03.2004 № 2 «О применении судами Российской Федерации ТК РФ»).
Выплаты за время вынужденного прогула производятся одновременно с изданием приказа об отмене увольнения (см. Определение Верховного суда РФ от 23.04.2010 № 5-В09-159). Как указал Верховный суд РФ, смысл процедуры восстановления на работе заключается именно в отмене правовых последствий увольнения путем отмены приказа об увольнении (а не путем издания приказа о восстановлении на работе после вынесения судом соответствующего решения). Следовательно, обязанность работодателя выплатить заработную плату за время вынужденного прогула наступает одновременно с отменой приказа об увольнении и восстановлением работника в прежней должности. Данная выплата является неотъемлемой частью процесса восстановления на работе.
Исходя из разъяснений Минфина и ФНС, выплата суммы среднего заработка за время вынужденного прогула, взысканной по решению суда с организации-работодателя в пользу ее работника, не признается компенсационной выплатой, освобождаемой от налогообложения на основании п. 3 ст. 217 НК РФ (см. письма Минфина России от 11.04.2016 № 03-04-05/20329, от 24.07.2018 № 02-06-05/51874, ФНС России от 04.04.2006 № 04-1-04/190, от 16.11.2011 № ЕД-3-3/3745). Других оснований для освобождения от обложения НДФЛ суммы среднего заработка за время вынужденного прогула, взысканной с организации на основании решения суда, ст. 217 НК РФ не содержит, соответственно, такие доходы подлежат обложению НДФЛ в установленном порядке.
Поскольку суммы среднего заработка за время вынужденного прогула в ст. 422 НК РФ не указаны, выплата среднего заработка за время вынужденного прогула подлежит обложению страховыми взносами на общих основаниях (см. письма Минфина России от 19.06.2018 № 03-04-05/41794, от 17.06.2016 № 02-07-05/35315).
