В Минфин поступило предложение о внесении изменений в Закон № 44-ФЗ в части уменьшения заказчиком цены контракта на сумму НДС в случае, если контракт заключается с поставщиком (подрядчиком, исполнителем), применяющим упрощенную систему налогообложения.
В письме от 07 мая 2020 г. № 24-03-07/36958 Минфин указал, что организация, применяющая специальный налоговый режим, осуществляя хозяйственную деятельность и приобретая товары (работы, услуги), уплачивает за них полную цену (включающую НДС), в случае если контрагент такой организации является плательщиком НДС. В дальнейшем организация, применяющая специальный налоговый режим, реализуя заказчику товары (работы, услуги) без учета НДС, не сможет покрыть свои издержки, возникающие в связи с тем, что ранее их оплата была произведена с учетом НДС.
Таким образом, снижение цены контракта, заключенного с контрагентом, применяющим специальный налоговый режим, на размер НДС, может привести такого контрагента к прямым убыткам.