В письме ФНС России от 01 апреля 2022 г. № СД-4-3/3960@ указано, что налоговый орган может аннулировать ошибочно поданное заявление об отказе от освобождения от НДС при реализации товаров, которые в соответствии с п. 3 ст. 149 НК РФ освобождаются от обложения НДС. Для этого налогоплательщику необходимо обратиться в налоговый орган.
Между тем необходимо отметить, что порядок аннулирования таких заявлений НК РФ не урегулирован. При этом материалами судебной практики подтверждается, что определяющее значение имеет не сам факт представления заявления об отказе от льготы, а применение или неприменение льготы, которое можно установить исходя из договоров, первичных документов, а также регистров бухгалтерского и налогового учета.